Por su ubicación e historia, las instalaciones coloniales del hotel son consideradas como parte del patrimonio cultural de la ciudad del Cuzco. Dividido en un ala colonial y otra moderna, el Hotel Picoaga ha sabido combinar arquerías de piedra, patios con piletas y murales propios de la arquitectura del siglo XVIII junto con las comodidades de un hotel de estilo contemporáneo.

Las habitaciones coloniales se ubican rodeando el patio central y conservan detalles originales de la época, como sus techos altos de vigas y portones de madera. Por su parte, las habitaciones modernas han sido pensadas para la comodidad de los huéspedes, en su amplitud, tranquilidad y equipamiento.

Todas las habitaciones están alfombradas, cuentan con aire acondicionado y calefacción, red de internet inalámbrica, servicio de bebidas y alimentos las 24 horas y baños recientemente remodelados.